Hằng năm, vào các ngày từ 14 - 16/3 âm lịch, nhân dân 9 xã 10 làng thuộc Tổng Nam Phù xưa tổ chức Lễ hội Tổng Nam Phù, hay còn gọi là lễ hội 9 xã 10 làng bởi Tổng Nam Phù xưa bao gồm 10 làng: Đông Phù, Mỹ Ả, Đông Trạch, Văn Uyên, Tranh Khúc, Tương Trúc, Tự Khoát, Việt Yên, Mỹ Liệt và Ninh Xá. Nay do sáp nhập địa giới hành chính nên 10 làng hiện thuộc các xã: Đông Mỹ, Ngũ Hiệp, Duyên Hà (huyện Thanh Trì) và Ninh Sở (huyện Thường Tín, Hà Nội).
Lễ hội Tổng Nam Phù nhằm tưởng nhớ công lao của Nhị vị Bồ Tát là hai vị công chúa Lý Từ Huy và Lý Từ Thục, con gái vua Lý Thái Tông đã có công mua ruộng và dạy nghề giúp dân. Nhị vị Sư Tổ thị sát thấy dân tổng Nam Phù vẫn còn cảnh đói nghèo vì thiếu ruộng canh tác, với tấm lòng từ bi, Nhị vị Sư Tổ đã chia 3.000 mẫu ruộng cho 10 làng, xuất hết tiền vàng nữ trang của mình để cấp vốn cho người nông dân khai khẩn ruộng đất, trồng lúa nước, trồng dâu nuôi tằm, làm các nghề thủ công, làm bánh chưng, bánh nếp, bánh gai, bánh dày ở làng Tranh Khúc; nghề bún, đậu phụ ở làng Đông Phù (Đông Mỹ). Khi nông nhàn, tháng ba ngày tám, Nhị vị sư Tổ dạy cho dân làng Tự Khoát nghề đan thúng, mủng, rổ, rá. Nhờ đó, dân làng Tự Khoát có nghề đan thúng nổi tiếng khi xưa.
Với quy mô 5 năm 1 lần hội lớn, Lễ hội Tổng Nam Phù năm 2024 được tổ chức với quy mô rất hoành tráng, thu hút hàng vạn người dân và du khách đến tham quan, chiêm bái.